Dopo 1'8 settembre 1943, avendo rifiutato l'adesione alla Repubblica di Salò, viene trasferito nel lager tedesco di Bergen-Belzen dove rimane prigioniero per quasi due anni e da dove ritorna debilitato nel fisico ma non nel morale Nel frattempo, nel 1944, muore il padre Enrico e al suo rientro in Italia alla fine del conflitto si trova la responsabilità della famiglia.

Riprende gli studi universitari per il suo grande desiderio di conoscenza e di formazione e si laurea in Scienze Agrarie all'Universita di Bologna. Si dedica all'insegnamento dapprima nelle scuole di avviamento agrario di Pieve di Soligo, poi docente all'Istituto Tecnico Agrario di Conegliano. In seguito assume l'incarico di Direttore Didattico del Circolo di Cison di Valmarino.

La sua fecondissima attività, amministrativa prima che politica, inizia nel 1948 quando diviene consigliere comunale di Pieve di Soligo. Nominato assessore, assume poi l'incarico di Sindaco (1953-1960) e sempre si distingue per il rapporto con la gente e la concretezza delle sue azioni.

Diventa membro della Giunta Provinciale amministrativa di Treviso: assessore ai Lavori Pubblici attua il piano di sistemazione delle strade provinciali, riuscendo a porre Treviso al primo posto fra le province italiane per la tempestività di attuazione delle opere. Particolarmente versato in problemi amministrativi ed economici, dirige il Comitato per lo studio e l'elaborazione del piano organico di sviluppo della Provincia e nel 1960 ne diviene vicepresidente.

Mentre svolge una intensa azione politica, Francesco Fabbri è anche uno dei più attivi promotori delle principali iniziative economico-sociali della provincia. É Presidente della Federazione Provinciale dell'Unione Regionale delle Cooperative, fondatore, presidente, sindaco di federazioni e asociazioni varie.

Nelle elezioni politiche del 1976 viene eletto Senatore della Repubblica e il 21 luglio assume l'incarico di Ministro della Marina Mercantile, ruolo che inizia subito a svolgere con grande disponibilità ed autorevolezza tanto da raccogliere attestati e simpatie fra i colleghi parlamentari.

Verso la fine di novembre del 1976 avverte i primi sintomi di un male che lo costringe ad un ricovero ospedaliero e poi ad un intervento che non dà gli esiti sperati. Nonostante tutto dalla sua casa di Solighetto continua a coordinare l'attività del suo ministero. Ma il male non gli offre tregua e il 20 gennaio 1977 Francesco Fabbri cessa di vivere. Il comune di Pieve di Soligo proclama il lutto cittadino, migliaia di persone si recano a rendere omaggio alla sua salma composta nella camera ardente allestita inizialmente nella chiesetta dell'ospedale e successivamente nel municipio di Pieve di Soligo.

I funerali si svolsero il 22 gennaio alla presenza di oltre 10 mila persone, tra cui le più importanti personalità nazionali politiche, istituzionali, militari e civili. Significative le parole del celebrante, il Vescovo di Vittorio Veneto Mons. Cunial: Un suo pregio e stato il sincero senso democratico, la sua fede nella libertà, alla ricerca ed alla conquista dei valori umani, quelli che portano alla liberazione degna dell'uomo. Sapeva distinguere tra libertà e mistificazione, tra schiettezza e sofisma, tra il bene e il male. La vita di Francesco Fabbri fu qualificata dalla fede cattolica dove seppe trarre ispirazione e forza per amare il prossimo.

A suo nome è intitolato il Centro di Cultura di Solighetto (ex Villa Brandolini), un centro studi a Conegliano, un Centro Sociale, diverse strade comunali ed una provinciale, la sala convegni del Consorzio Bim Piave in Pieve di Soligo dove si trova un suo busto in bronzo, per ricordarne la figura e l'opera.